我國在國際多式聯(lián)運(yùn)中存在的問題：
　　(1). 相互交叉重疊，缺乏系統(tǒng)性和可操作性
　　(2). 服務(wù)意識(shí)差、手續(xù)繁雜
　　有關(guān)管理部門的服務(wù)意識(shí)差、手續(xù)繁雜，一些相關(guān)部門仍靠收費(fèi)補(bǔ)貼行政開支，收費(fèi)名目繁多致使航運(yùn)企業(yè)負(fù)擔(dān)過重.
　　(3). 不同運(yùn)輸方式的競爭
　　盡管各個(gè)運(yùn)輸之間沒有必然的聯(lián)系,但隨著我國鐵路運(yùn)輸網(wǎng)絡(luò)的完善、大范圍的提速和服務(wù)的改善，以及我國高速公路的快速發(fā)展與在合理的運(yùn)輸半徑內(nèi)的絕對優(yōu)勢，使水路集裝箱短途運(yùn)輸將面臨強(qiáng)有力的競爭.
　　而面對不同的運(yùn)輸方式帶來的壓力，承運(yùn)商為了招攬生意,使市場上出現(xiàn)許多諸如非法手段攬貨、競相壓價(jià)、行業(yè)壟斷等不規(guī)范行為，出現(xiàn)某種程度的無序競爭狀態(tài) .
　　(4). 碼頭基礎(chǔ)設(shè)施、技術(shù)裝備落后
　　我國沿海中小港口以及內(nèi)河港口基本上是以多用途碼頭、雜貨碼頭裝卸集裝箱，碼頭基礎(chǔ)設(shè)施、技術(shù)裝備落后。內(nèi)河航道等級總體上較低，不能適應(yīng)集裝箱機(jī)動(dòng)駁快速化和深水化的要求；聯(lián)結(jié)內(nèi)陸鐵路、中轉(zhuǎn)站、貨場和集卡等設(shè)備不足，綜合運(yùn)輸服務(wù)能力較差.
　　(5). 海關(guān)監(jiān)管方面
　　在海關(guān)監(jiān)管方面，特別是不同關(guān)區(qū)之間的協(xié)調(diào)，中轉(zhuǎn)手續(xù)，出口箱出境證明，報(bào)關(guān)單回執(zhí)聯(lián)的簽退周期等方面的工作還有待改善，以使其更加有效、更加簡便。各關(guān)區(qū)之間加強(qiáng)聯(lián)系，協(xié)調(diào)一致，減少中間環(huán)節(jié)，簡化一些煩瑣的手續(xù).
　　(6). 信息管理手段運(yùn)用不足
　　我國集裝箱內(nèi)支線運(yùn)輸管理中先進(jìn)的信息管理手段運(yùn)用不足，大多數(shù)港口還是采用原始的手工數(shù)據(jù)處理方式，運(yùn)輸單證與信息不標(biāo)準(zhǔn)，流轉(zhuǎn)慢，各環(huán)節(jié)銜接不順.
　　國際多式聯(lián)運(yùn)在我國改革探究比如說， 規(guī)范國內(nèi)海上集裝箱運(yùn)輸.建立準(zhǔn)入線，由報(bào)備制改為申報(bào)核準(zhǔn)式，如船東資質(zhì)、運(yùn)力規(guī)格、包括規(guī)范船舶安全證書審驗(yàn)、上線與下線的條件、經(jīng)營航線與區(qū)域的能力，或者可制定大、中、小三類船公司的競爭合作優(yōu)勢、互補(bǔ)的優(yōu)惠條件等.