中醫(yī)藥科學(xué)研究是中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院的中心任務(wù)，50年來(lái)，中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院在中醫(yī)藥基礎(chǔ)理論研究和重大疾病防治及中藥新藥開(kāi)發(fā)研究等方面均取得了顯著成就。截止2004年底，全院共獲得科研成果近900項(xiàng)，其中獲國(guó)家級(jí)、部局級(jí)獎(jiǎng)近300項(xiàng)；現(xiàn)有院級(jí)以上在研課題482項(xiàng)，其中國(guó)家級(jí)課題200項(xiàng)、部局級(jí)課題258項(xiàng)；擁有國(guó)家新藥（中藥）臨床試驗(yàn)研究中心（GCP）、國(guó)家規(guī)范化中藥藥理實(shí)驗(yàn)室、中國(guó)中醫(yī)藥文獻(xiàn)檢索中心和BSL－3實(shí)驗(yàn)室，是國(guó)家中藥安全性評(píng)價(jià)中心（GLP）與中藥復(fù)方藥物開(kāi)發(fā)國(guó)家工程研究中心建設(shè)單位。

    中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院充分發(fā)揮中醫(yī)醫(yī)療的優(yōu)勢(shì)和特色，為廣大患者提供良好的服務(wù)，現(xiàn)有病床1500多張。附屬西苑醫(yī)院、廣安門(mén)醫(yī)院是全國(guó)三級(jí)甲等中醫(yī)醫(yī)院和全國(guó)示范中醫(yī)醫(yī)院。望京醫(yī)院是以骨傷科為主的綜合性三級(jí)甲等中醫(yī)醫(yī)院，眼科醫(yī)院是以中醫(yī)眼科為特色的專(zhuān)科醫(yī)院。各附屬醫(yī)院在腫瘤、心腦血管病、老年病、糖尿病以及肛腸、皮膚、泌尿等各科疾病及多種常見(jiàn)病、多發(fā)病和疑難重癥的治療方面，具有豐富的經(jīng)驗(yàn)和獨(dú)特的療效，在國(guó)內(nèi)外有較高的聲譽(yù)。

    中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院是培養(yǎng)高層次中醫(yī)藥人才的重要基地，現(xiàn)有中醫(yī)學(xué)、中藥學(xué)、中西醫(yī)結(jié)合三個(gè)一級(jí)學(xué)科所涵蓋的所有學(xué)科專(zhuān)業(yè)的博士、碩士授予權(quán)，具有臨床醫(yī)學(xué)專(zhuān)業(yè)學(xué)位授予和在職人員申請(qǐng)學(xué)位的資質(zhì)；設(shè)有中西醫(yī)結(jié)合、中醫(yī)學(xué)、中藥學(xué)三個(gè)一級(jí)學(xué)科的博士后工作站�！≈袊�(guó)中醫(yī)科學(xué)院圖書(shū)館是全國(guó)藏書(shū)最多的中醫(yī)藥專(zhuān)業(yè)圖書(shū)館，其中珍本、善本、孤本書(shū)籍2萬(wàn)余冊(cè)。中國(guó)醫(yī)史博物館是中國(guó)收藏文物最多的中醫(yī)專(zhuān)業(yè)博物館，收藏文物3000余件。

    中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院主辦多種全國(guó)性的中醫(yī)藥專(zhuān)業(yè)期刊，其中在國(guó)內(nèi)外影響較大的有《中醫(yī)雜志》、《中國(guó)中西醫(yī)結(jié)合雜志》、《中國(guó)中藥雜志》、《中國(guó)針灸》、《針刺研究》、《中國(guó)骨傷》、《中華醫(yī)史雜志》、《中國(guó)中醫(yī)藥信息雜志》、《中國(guó)中醫(yī)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)雜志》等。

    作為中國(guó)傳統(tǒng)醫(yī)藥對(duì)外合作與交流的重要窗口，中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院與世界上100多個(gè)國(guó)家和地區(qū)的醫(yī)藥界、科研院所、高等院校、企業(yè)及民間團(tuán)體有廣泛友好的聯(lián)系與交流，在國(guó)際傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)界有較大的影響。