(1)容易出現(xiàn)配置重復(fù)、資源浪費(fèi)的問(wèn)題。如果一個(gè)公司多個(gè)項(xiàng)目都按項(xiàng)目式進(jìn)行管理組織，在資源的安排上很可能出現(xiàn)項(xiàng)目?jī)?nèi)部利用率不高，而項(xiàng)目之間則是重復(fù)與浪費(fèi)。 
　　(2)項(xiàng)目組織成為一個(gè)相對(duì)封閉的組織，公司的管理與決策在項(xiàng)目管理組織中貫徹可能遇到阻礙。
　　(3)項(xiàng)目團(tuán)隊(duì)與公司之間的溝通基本上依靠項(xiàng)目經(jīng)理，容易出現(xiàn)溝通不夠和交流不充分的問(wèn)題。
　　(4)項(xiàng)目團(tuán)隊(duì)成員在項(xiàng)目后期沒(méi)有歸屬感。團(tuán)隊(duì)成員不得不為項(xiàng)目結(jié)束后的工作考慮投入相當(dāng)?shù)木�力，影響�?xiàng)目的后期工作。
　　(5)由于項(xiàng)目管理組織的獨(dú)立性，使項(xiàng)目組織產(chǎn)生小團(tuán)體觀(guān)念，在人力資源與物資資源上出現(xiàn)“囤積”的思想，造成資源浪費(fèi)；同時(shí)，各職能部門(mén)考慮其獨(dú)立性，對(duì)其資源的支持會(huì)有所保留，影響項(xiàng)目的最好完成。